Ma’had Aly Yanbu’ul Qur’an berlokasi di Kompleks Pondok Tahfidh Yanbu'ul Qur'an Kabupaten Kudus. Ma’had Aly ini merupakan pusat perguruan tinggi Islam berbasis pondok pesantren. Di antara keutamaan Ma’had Aly ini adalah sistem perkuliahan yang terintegrasi dengan kajian kitab turats khas pondok pesantren sehingga Ma’had Aly ini menjadi pusat kajian al-Qur’an dan Ilmu al-Qur’an serta lahirnya intelektual-intelektual masa depan yang berjiwa qur’ani